본 발명은 자동화 로봇의 기구장치용 제어 시스템 및 그 방법에 관한 것으로, 프로그램 언어를 모터 제어에 적합하게 라이브러리화시킨 그래픽 언어 기반의 프로그램 생성 환경을 제공하고, 상기 환경에서 생성된 제어 프로그램을 기반으로 기구장치 내 각 모터의 구동을 제어함으로써, 제어 프로그램의 간단한 변경만으로 각종 기구장치를 제어할 수 있는 자동화 로봇의 기구장치용 제어 시스템 및 그 방법을 제공하고자 한다. 이를 위하여, 본 발명은 자동화 로봇의 기구장치용 제어 시스템에 있어서, 프로그램 언어를 모터 제어에 적합하게 라이브러리화시킨 그래픽 언어 형태의 소프트웨어를 탑재하여, 사용자에게 그래픽 언어 기반의 제어 프로그램 생성 환경을 제공하는 제어 프로그램 생성장치; 상기 제어 프로그램 생성장치가 생성한 제어 프로그램을 기반으로 모터 구동부를 제어하는 제어장치; 및 적어도 하나 이상의 서보 모터를 구동시키는 상기 모터 구동부를 포함한다.