본 발명의 사용자 지향적 전자 임상시험 데이터 관리시스템은 데이터의 입력 또는 수정에 대한 데이터 권한이 개별적으로 부여된 담당자 데이터와 임상 피험자에 대한 데이터를 포함하는 객체 데이터가 계층 구조를 가지는 복수 개의 데이터그룹으로 디자인된 eCRF가 저장된 메인저장부; 각 객체 데이터마다 로그인 정보에 해당하는 데이터 권한이 부여된 상기 eCRF를 로그인에 의하여 접속한 담당자에게 전송하는 객체 전송부; 상기 담당자로부터 입력된 입력 데이터를 결합시켜 상기 eCRF가 갱신 저장되도록 제어하는 제어부; 및 상기 입력 데이터가 기 설정된 조건에 부합되지 않는 경우 이에 대한 쿼리정보를 생성하여 저장하고 생성된 쿼리정보를 해당 담당자에게 전송하는 데이터 확인부를 포함하는 것을 특징으로 한다. 상기 본 발명에 의하면 더욱 사용자 지향적인 데이터 입력 및 수정 인터페이싱 환경을 통하여 데이터 가공, 분리 및 활용 등의 효율성을 더욱 제고시킴과 동시에 데이터 신뢰성을 더욱 간단하고 효과적으로 구현할 수 있는 전자 임상시험 데이터 관리 시스템을 제공할 수 있다.