수중 생물 폐사 방지용 해수의 이산화탄소 분압 측정 장치는 미세 해양 생물이 서식하는 해수를 수납하기 위한 공간을 제공하는 수조; 상기 해수에 일부가 잠겨 내부에 격리 공간이 형성되며 상기 해수가 유출입 되는 개구를 갖는 플로팅 부재; 상기 플로팅 부재의 하부에 연통되며 상기 해수에 잠기는 버블 도입관; 상기 플로팅 부재 및 상기 버블 도입관의 하단에 각각 연결되어 상기 격리 공간의 공기를 흡입하여 상기 버블 도입관 내로 제공하는 공기 순환 배관; 상기 공기 순환 배관 내로 제공된 공기를 샘플링하여 샘플링된 상기 공기 내의 이산화탄소 분압을 측정하는 측정기를 포함한다.