본 발명은 연료전지 발전과 열전발전을 이용한 복합 발전 설비에 관한 것으로, 이는 연료전지와, 연료전지에 연료를 공급하는 연료공급 배관, 및 연료전지에서 발생되는 고온의 배기가스를 이송하는 배기가스 배관을 포함하는 연료전지 발전 설비; 및 상기 연료공급 배관을 저열원 흡수부로 하고 상기 배기가스 배관을 고열원 흡수부로 하는 제 1 열전발전 모듈과, 상기 배기가스 배관을 통과한 배기가스가 배출되는 연도를 고열원 흡수부로 하고 대기를 저열원 흡수부로 하는 제 2 열전발전 모듈을 포함하는 열전발전 설비;로 구성되어서, 본 발명에 의하면 연료전지 발전 설비의 폐열을 이용한 열전발전을 통해 전력을 생산함으로써 종래 연료전지 발전 설비와 지역난방 설비의 열효율을 극대화하고 친환경 발전 설비를 이룰 수 있는 효과가 있다.