본 발명에 따른 용존 유기물 추출 장치는 해수가 담긴 제1 시료용기에 연결되는 주입밸브; 상기 제1 시료용기와 상기 주입밸브 사이에 구비되고, 상기 제1 시료용기에 담긴 해수를 상기 주입밸브로 전달하는 제1 연동펌프; 상기 주입밸브로부터 전달되는 해수 중의 입자성 유기물을 분리하는 필터부; 상기 필터부로부터 유출되는 해수 중의 용존 유기물을 내부에 흡착시키는 흡착관; 유기용매를 수용하고 있는 복수의 용매용기와 상기 주입밸브 사이에 구비되고, 상기 복수의 용매용기 중 적어도 하나에 수용된 유기용매를 상기 주입밸브에 유입시키는 제1 실린지 펌프; 염산 용액을 수용하고 있는 염산용기와 상기 주입밸브 사이에 구비되고, 상기 염산 용액을 상기 주입밸브에 유입시키는 제2 실린지 펌프; 상기 주입밸브에 연결되고, 상기 필터부 및 상기 흡착관에 건조 가스를 전달하는 가스 주입부; 및 상기 주입밸브, 상기 제1 연동펌프, 상기 제1 실린지 펌프, 상기 제2 실린지 펌프 및 상기 가스 주입부의 구동을 제어하여 상기 필터부 및 상기 흡착관으로부터 상기 입자성 유기물 및 상기 용존 유기물을 추출하는 동작을 제어하는 제어부를 포함하는 것을 특징으로 한다. 이러한 용존 유기물 추출 장치는 해수, 담수와 같은 액상 시료에 용존 형태로 존재하는 유기물을 용이하게 분리 및 추출할 수 있는 효과가 있다.