본 발명은 인산염 용해 미생물을 이용하여 모나자이트를 생물학적으로 분해하여 희토류 금속을 회수하는 기술에 관한 것이다. 상기 목적을 달성하기 위해 본 발명은, (a)배지를 준비하는 단계와 (b)상기 배지에 모나자이트를 투입시키는 단계와 (c)상기 (b)단계의 배지에 미생물을 투입시키는 단계와 (d)상기 (c)단계의 미생물을 배양시키는 단계 및 (e)상기 (d)단계의 배양된 미생물을 이용하여, 모나자이트로부터 희토류 금속을 침출시키는 단계를 포함하는 모나자이트에서 미생물을 이용하여 희토류 금속을 추출하는 방법을 제공한다. 본 발명에 따르면, 희토류 금속을 경제적으로 회수할 수 있으며, 기존 공정에 비해 공정을 간소화 하면서도, 환경오염을 시키지 않는 장점이 있다.