본 발명은 고흡수성 마그네슘 복합체의 제조방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 본 발명은 고흡수성 마그네슘 복합체의 제조방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 우유단백질을 효소분해하여 얻은 단백분해물을 마그네슘과 혼합하여 반응시키는 고흡수성 마그네슘 복합체의 제조방법에 관한 것이다. 본 발명에 따르면 체내 흡수가 용이한 마그네슘 복합체를 친환경적인 방법에 의해 효율적으로 제조할 수 있고, 노화를 촉진하며 각종 질병의 원인이 되는 활성산소를 저감하는 항산화 활성이 뛰어난 마그네슘 복합체를 제공할 수 있다.